В том случае, если организация уплатила госпошлину за какое-либо юридическое действие, например за выдачу лицензии, но затем решила, что она, собственно, ей и не нужна вовсе, то госпошлину можно вернуть. Правда это возможно только при условии, когда компания еще не обратилась в уполномоченный орган за получением лицензии. В противном случае вернуть госпошлину уже не удастся. В письме от 2 сентября 2013 г. № ММВ-18-15/970 представители ФНС указали, что в ситуации, когда компания получила мотивированный отказ в выдаче разрешения (лицензии), уплаченная сумма госпошлины возврату не подлежит.

Свою позицию чиновники обосновали достаточно просто. Основания и порядок возврата или зачета госпошлины установлены статьей 333.40 Налогового кодекса. Подпунктом 4 пункта 1 статьи 333.40 Кодекса уплаченная госпошлина подлежит возврату частично или полностью в случае отказа лиц, которые ее уплатили, от совершения юридически значимого действия до обращения в уполномоченный орган (к должностному лицу) совершающий (совершающему) данное юридически значимое действие. Проще говоря, если пошлину уплатили, но за выдачей разрешения (лицензии) не обратились, то госпошлина подлежит возврату. Ну а если чиновники работали, рассматривали заявку на выдачу лицензии, то госпошлину уже не вернуть, даже если в итоге вынесено решение об отказе в выдаче лицензии. 

Надо сказать, что размер госпошлины за отдельные юридически значимые действия далеко не «копеечный». Поэтому, если заветного разрешения на осуществление того или иного вида деятельности как не было, так и нет, то встает вопрос: «А за что же мы заплатили?» Однако он уже был предметом рассмотрения Конституционным Судом. Увы, в постановлении от 23 мая 2013 г. № 11-П представители КС признали законным отказ в возврате уплаченной госпошлины при наличии вынесенного решения об отказе в предоставлении лицензии.