Федеральная налоговая служба категорически против закрепления в правовых актах права хозяйствующего субъекта при выставлении и получении счета-фактуры в электронном виде выбирать, использовать услуги оператора электронного документооборота или нет. Об этом ФНС сообщает в письме от 30 апреля 2015 г. № БС-18-6/499@.

Чиновники свою позицию аргументируют следующим образом. Счет-фактура является важным инструментом исполнения функций по контролю и надзору в области налогов и сборов и без метки времени (подтверждения даты отправки, которое выдает оператор электронного документооборота) теряет свою значимость. Технологические документы, формируемые операторами электронного документооборота как независимой стороной, являются документарным подтверждением факта обмена электронными счетами-фактурами при возникновении спорных ситуаций между налогоплательщиками и контролирующими органами, в том числе при их рассмотрении в судебном порядке.